店舗内装工事、コールドテーブルや家具などの購入、食器類の購入などの中でも「１ケ当たり」、あるいは「１工事の単価」が２０万以上のものなら資産に、１５万以上２０万未満なら一括償却資産に、また１５万未満のものなら全部費用で落とせます。
日常使いの食器は全部費用で落とせる値段だと想像します。
ん～、株式会社で建物を建てたら、まずは一切を建設仮勘定として計上し、その後、正しい資産・費用科目に全部振替ます。
当社はＰＣＡ会計で二つの株式会社があるのですがやよいの青色申告のソフトを実際に使用した事がないのでどういう勘定科目があるのか（科目も追加できるのでしょうが）今一つわかりません。
やよいの青色申告のサポートセンターがあると思うので電話で問い合わせてみては如何でしょうか。
開店するのに要した費用６００万円分を貴方が立て替え、お店の口座から後日、自分の口座に戻したとのことですから立て替えた時の貸方科目は「事業主借」でＯＫで借方は上記の通りサポートセンターに問い合わせみて下さい。
店の口座から自分の口座へは振り込みで返しましたか？現金で返しましたか？振込の方がベターだと思いますがその際はお店が「事業主借」を返済したことになりますのでお店にとっては負債を返済した事になり、借方が「事業主借」、貸方が「現金」もしくは「普通預金」などどなります。
融資を受けたお金がお店の口座に振り込まれた時は借方「普通預金」：貸方「借入金」です。
今後のためには（もうないのかもしれませんが）自分の口座から現金で支払う（立て替える）ことはやめて口座から振り込むスタイルを取った方が記録が残り後から処理をするのには良いと思います。
事業主からお店に貸付ける場合も振り込みで。
勿論、請求書は大事です。
取引銀行がインターネットバンキングを取り扱っているのならとても便利なので利用すると良いと思います。
当社は月額使用料は５千円ですが利用頻度、銀行へ出向く、待つ時間のロスを考えれば元はとれていますし振込手数料を当社が負担しなければならない場合も手数料が安いのでメリットがあります。